Måndagen 24 juni 2013.-Forskare från Australien och USA tillhandahåller ny kunskap för att förstå den genomgående tredimensionella strukturen, en av de största utmaningarna för närvarande inför genomik och genetik, vars slutsatser den publicerar i sin digitala utgåva. Naturgenetik.
Cirka tre meter DNA är nära vikta i kärnan i varje cell i vår kropp, vilket gör att vissa gener kan "uttrycka" eller aktivera, exklusive andra. Läkarna Tim Mercer och John Mattick från Garvan Institute for Medical Research i Sydney och professor John Stamatoyannopoulos vid University of Washington i Seattle analyserade genomets 3D-struktur med hög upplösning.
Genen består av "exoner" och "introner", varav de första är sekvenserna som kodar och uttrycker proteinerna, och de sista sträckorna av icke-kodande DNA i mediet. När gener kopieras eller transkriberas, från DNA i RNA, skärs eller "splitsas" intronsekvenser och de återstående exonerna kedjas samman för att bilda en sekvens som kodar för ett protein. Beroende på exonerna som är spända kan samma gen generera olika proteiner.
Genom användning av stora mängder data från ENCODE-projektet har Dr. Tim Mercer och hans kollegor drömt vikningen av genomet och konstaterat att även inom en gen kan de utvalda exonerna lätt exponeras. "Föreställ dig en lång och oerhört komplicerad vinstock, dess tvinnade grenar som presenterar vissa druvor som lätt kan rippas av, samtidigt som du gömmer andra utanför deras räckvidd, " ger han ett exempel. Mercer.
"Föreställ dig samtidigt en lat fruktplockare som bara plockar druvorna till hands", tillägger han. "Samma princip gäller för genomet. Specifika gener och till och med specifika exoner är inom räckhåll för vikning." I den meningen påpekar denna forskare att forskare under de senaste åren har börjat uppskatta hur genomvikning hjälper till att avgöra hur det uttrycks och regleras.
"Denna studie ger den första indikationen på att den tredimensionella strukturen i genomet kan påverka generens skarvning. Vi kan dra slutsatsen att genomet veckas på ett sådant sätt att promotorregionen, den sekvens som initierar transkriptionen av en gen, är hittade bredvid exonerna och de tas alla till transkriptionsmaskineriet, ”betonar han.
"Detta stöder ett nytt sätt att titta på saker, som genomet böjer sig runt transkriptionsmaskineriet, snarare än tvärtom. De gener som kommer i kontakt med transkriptionsmaskineriet får kopior, medan de delar som kretsar långt borta de ignoreras, "avslutar denna forskare.
Källa:
Taggar:
Regeneration Nyheter Hälsa
Cirka tre meter DNA är nära vikta i kärnan i varje cell i vår kropp, vilket gör att vissa gener kan "uttrycka" eller aktivera, exklusive andra. Läkarna Tim Mercer och John Mattick från Garvan Institute for Medical Research i Sydney och professor John Stamatoyannopoulos vid University of Washington i Seattle analyserade genomets 3D-struktur med hög upplösning.
Genen består av "exoner" och "introner", varav de första är sekvenserna som kodar och uttrycker proteinerna, och de sista sträckorna av icke-kodande DNA i mediet. När gener kopieras eller transkriberas, från DNA i RNA, skärs eller "splitsas" intronsekvenser och de återstående exonerna kedjas samman för att bilda en sekvens som kodar för ett protein. Beroende på exonerna som är spända kan samma gen generera olika proteiner.
Genom användning av stora mängder data från ENCODE-projektet har Dr. Tim Mercer och hans kollegor drömt vikningen av genomet och konstaterat att även inom en gen kan de utvalda exonerna lätt exponeras. "Föreställ dig en lång och oerhört komplicerad vinstock, dess tvinnade grenar som presenterar vissa druvor som lätt kan rippas av, samtidigt som du gömmer andra utanför deras räckvidd, " ger han ett exempel. Mercer.
"Föreställ dig samtidigt en lat fruktplockare som bara plockar druvorna till hands", tillägger han. "Samma princip gäller för genomet. Specifika gener och till och med specifika exoner är inom räckhåll för vikning." I den meningen påpekar denna forskare att forskare under de senaste åren har börjat uppskatta hur genomvikning hjälper till att avgöra hur det uttrycks och regleras.
"Denna studie ger den första indikationen på att den tredimensionella strukturen i genomet kan påverka generens skarvning. Vi kan dra slutsatsen att genomet veckas på ett sådant sätt att promotorregionen, den sekvens som initierar transkriptionen av en gen, är hittade bredvid exonerna och de tas alla till transkriptionsmaskineriet, ”betonar han.
"Detta stöder ett nytt sätt att titta på saker, som genomet böjer sig runt transkriptionsmaskineriet, snarare än tvärtom. De gener som kommer i kontakt med transkriptionsmaskineriet får kopior, medan de delar som kretsar långt borta de ignoreras, "avslutar denna forskare.
Källa:
